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Enregistrement W2009023625 · doi:10.1155/2013/983641

Quantitative Trait Loci Analysis of Folate Content in Dry Beans,<i>Phaseolus vulgaris</i>L.

2013· article· en· W2009023625 sur OpenAlexafffund
Sameer Khanal, Jianming Xue, Raja Khanal, Wanzhuo Xie, Jianzheng Shi, K. Peter Pauls, Alireza Navabi

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Agronomy · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Guelph
Mots-clésPhaseolusQuantitative trait locusDiallel crossBiologyPopulationDry weightDry beanCultivarLegumeAnimal scienceDry matterHorticultureBotanyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dry beans ( Phaseolus vulgaris L.) contain high levels of folates, yet the level of folate may vary among different genotypes. Folates are essential vitamins and folate deficiencies may lead to a number of health problems. Among the different forms of folates, 5-methyltetrahydrofolate (5MTHF) comprises more than 80% of the total folate in dry beans. The objectives of this paper were to compare selected genotypes of dry beans for the folate content of the dry seeds and to identify quantitative trait loci (QTL) associated with the folate content in a population derived from an inter-gene-pool cross of dry beans. The folate content was examined in three large-seeded (AC Elk, Redhawk, and Taylor) and one medium-seeded (Othello) dry bean genotypes, their six F 1 (i.e., one-way diallel crosses), and the F 2 of Othello/Redhawk that were evaluated in the field in 2009. Total folate and 5MTHF contents were measured twice with one-hour time interval. The significant variation (<mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M1"><mml:mrow><mml:mi>P</mml:mi><mml:mo>&lt;</mml:mo><mml:mn>0.05</mml:mn></mml:mrow></mml:math>) in the folate content was observed among the parental genotypes, their F 1 progeny, and members of the F 2 population, ranging from 147 to 345 μ g/100 g. There was a reduction in the 5MTHF and total folate contents in the second compared to the first measurement. Dark red kidney variety Redhawk consistently had the highest and pinto Othello had the lowest total folate and 5MTHF contents in both measurements. A single marker QTL analysis identified three QTL for total folate and 5MTHF contents in the first measurement and one marker for the total folate in the second measurement in the F 2 . These QTL had significant dominance effects and individually accounted for 7.7% to 10.5% of the total phenotypic variance. The total phenotypic variance explained by the four QTL was 18% for 5MTHF and 19% for total folate in the first measurement, but only 8% for total folate in the second measurement.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,940
Score d'incertitude au seuil0,859

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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