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Enregistrement W2009133848 · doi:10.4141/cjas07005

Cloning and sequencing of <i>GH</i>, <i>H-FABP</i> and <i>HSP72</i> genes in yak

2007· article· en· W2009133848 sur OpenAlexvenueno aff
Jincheng Zhong, Zhijie Ma, Jiangtao Ou, Xiao Zhu, Shenggang Liu

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Animal Science · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneBiologyZebuIntronExonGeneticsComplementary DNAPhylogenetic treeCoding regionNucleic acid sequenceSignal peptideMolecular biologyPeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The growth hormone (GH) gene, the heart fatty acid binding protein (H-FABP) gene and the heat shock protein 72 (HSP72) gene of the yak (Bos grunniens) were cloned and sequenced. The sequences were compared with those of other animals, and phylogenetic trees were constructed by the NJ (neighborhood joining) method. Results showed that the yak GH gene was composed of five exons (13, 161, 117, 162 and 198 bp) and four introns (248, 225, 229 and 275 bp). The cDNA of GH was a 654 bp nucleotide encoding a putative protein of 217 amino acid (AA) residuals, with a signal peptide of 26 AAs and the mature peptide of 191 AAs. The H-FABP gene was composed of four exons (73, 173, 102 and 54 bp) and three introns (3460, 1892 and 1495 bp). The cDNA was 402 bp encoding a putative protein of 133 AAs. The yak HSP72 gene was an intron-free 1926bp nucleotide, encoding a protein of 641 AAs. The data suggest that the three genes from the yak were highly conserved with other species at the nucleic acid level. The results of the phylogenetic trees reflect the molecular evolution relationship among these species, consistent with the zoological classification. The genetic distance calculated by the nucleotide sequence of the GH gene’s coding region indicated that genetic distances among yak, cattle, gayal and zebu were relatively small, but genetic distances between these four species and buffalo were relatively large. Therefore, it was more reasonable to consider yak, cattle, gayal and zebu as independent species of the genus Bos, while buffalo belongs to another category (Bubalus). Key words: Yak, GH gene, H-FABP gene, HSP72 gene, phylogenetic evolution

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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