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Enregistrement W2009178745 · doi:10.4161/auto.21007

Crohn disease<i><i>ATG16L1</i></i>polymorphism increases susceptibility to infection with<i><i>Helicobacter pylori</i></i>in humans

2012· article· en· W2009178745 sur OpenAlex
Deepa Raju, Séamus Hussey, Nicola L. Jones

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueAutophagy · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAutophagyBiologyATG16L1Helicobacter pyloriPathogenesisImmunologyGastritisMicrobiologyCancer researchGeneticsApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autophagy plays key roles both in host defense against bacterial infection and in tumor biology. Helicobacter pylori (H. pylori) infection causes chronic gastritis and is the single most important risk factor for the development of gastric cancer in humans. Its vacuolating cytotoxin (VacA) promotes gastric colonization and is associated with more severe disease. Acute exposure to VacA initially triggers host autophagy to mitigate the effects of the toxin in epithelial cells. Recently, we demonstrated that chronic exposure to VacA leads to the formation of defective autophagosomes that lack CTSD/cathepsin D and have reduced catalytic activity. Disrupted autophagy results in accumulation of reactive oxygen species and SQSTM1/p62 both in vitro and in vivo in biopsy samples from patients infected with VacA(+) but not VacA(-) strains. We also determined that the Crohn disease susceptibility polymorphism in the essential autophagy gene ATG16L1 increases susceptibility to H. pylori infection. Furthermore, peripheral blood monocytes from individuals with the ATG16L1 risk variant show impaired autophagic responses to VacA exposure. This is the first study to identify both a host autophagy susceptibility gene for H. pylori infection and to define the mechanism by which the autophagy pathway is affected following H. pylori infection. Collectively, these findings highlight the synergistic effects of host and bacterial autophagy factors on H. pylori pathogenesis and the potential for subsequent cancer susceptibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle