<i>In vitro</i> reconstitution and activity of a C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The genomes of hyperthermophilic Archaea encode dozens of methylation guide, C/D box small RNAs that guide 2'-O-methylation of ribose to specific sites in rRNA and various tRNAs. The genes encoding the Sulfolobus homologues of eukaryotic proteins that are known to be present in C/D box small nucleolar ribonucleoprotein (snoRNP) complexes were cloned, and the proteins (aFIB, aNOP56, and aL7a) were expressed and purified. The purified proteins along with an in vitro transcript of the Sulfolobus sR1 small RNA were reconstituted in vitro, into an RNP complex. The order of assembly of the three proteins onto the RNA was aL7a, aNOP56, and aFIB. The complex was active in targeting S-adenosyl methionine (SAM)-dependent, site-specific 2'-O-methylation of ribose to a short fragment of ribosomal RNA (rRNA) that was complementary to the D box guide region of the sR1 small RNA. The presence of aFIB was essential for methylation; mutant proteins having amino acid replacements in the SAM-binding motif of aFIB were able to assemble into an RNP complex, but the resulting complexes were defective in methylation activity. These experiments define the minimal number of components and the conditions required to achieve in vitro RNA guide-directed 2'-O-methylation of ribose in a target RNA.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle