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Enregistrement W2009205448 · doi:10.1097/pgp.0b013e31820d20ba

Biomarker Expression in Pelvic High-grade Serous Carcinoma

2011· article· en· W2009205448 sur OpenAlexaff
Martin Köbel, Dmitry Turbin, Steve E. Kalloger, Dongxia Gao, David G. Huntsman, C. Blake Gilks

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Gynecological Pathology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOvarian cancer diagnosis and treatment
Établissements canadiensVancouver General HospitalFoothills Medical CentreUniversity of CalgaryBC Cancer AgencyCalgary Laboratory Services
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPDGFRBOvarian carcinomaPathologySerous fluidSerous carcinomaTissue microarrayBiomarkerOvarian cancerBiologyCarcinomaMedicineCancerOncologyImmunohistochemistryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neoadjuvant therapy has an emerging role in the treatment of high-stage ovarian carcinoma. Some ovarian carcinoma subtypes do not respond well to standard chemotherapy, making accurate subtype diagnosis before starting therapy important. This diagnosis is frequently based on omental biopsy specimens. In particular, with very small biopsies, immunostaining for diagnostic biomarkers may be needed. To assess intratumoral heterogeneity of biomarker expression in pelvic high-grade serous carcinoma, we compared the expression of a set of 10 biomarkers between ovarian and omental sites. Tissue microarrays were constructed from 123 high-grade serous carcinomas with paired ovarian and omental tumor samples. These samples were stained with biomarkers that have been used in ovarian carcinoma subtype diagnosis (WT1, TP53/p53, MUC16/CA125, CDKN2A/p16), and with biomarkers of the tumor microenvironment (CD8, CD163, SPARC, PDGFRB), cell adhesion (CDH1/E-Cadherin), and proliferation (Ki67) as well. Expression frequencies in samples from the 2 sites were compared, as was concordance at the 2 sites for individual tumors. The 2 markers of desmoplastic stromal response (PDGFRB, SPARC) were more frequently expressed in the omentum compared with the ovary (P<0.001; McNemar test). The other 8 markers did not show a significant difference in the frequency of expression between sites. Within individual cases, some markers such as Ki67 and CDKN2A showed variability, indicating that these markers are affected by intratumoral heterogeneity. The intratumoral variability for MUC16, TP53, and WT1 was modest. Commonly used diagnostic markers, such as TP53 and WT1, show little variability between ovarian and omental sites, suggesting that they can be successfully used in small biopsy specimens from extraovarian sites. In contrast, markers of host stromal response do vary between sites, suggesting a biologic difference of the microenvironment at different sites that should be taken into account when tissue-based research is carried out.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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