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Enregistrement W2009253784 · doi:10.2174/157436210790226537

Mechanism, Structure, and Inhibition of O-GlcNAc Processing Enzymes

2010· article· en· W2009253784 sur OpenAlexaff
T.M. Gloster, David J. Vocadlo

Notice bibliographique

RevueCurrent Signal Transduction Therapy · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésEnzymeTransferaseBiochemistryChemistryPhosphorylationMechanism (biology)GlycosyltransferaseUridineGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The post-translational modification of nucleocytoplasmic proteins with O-linked 2-acetamido-2-deoxy-d-glucopyranose (O-GlcNAc) is a topic of considerable interest and attracts a great deal of research effort. O-GlcNAcylation is a dynamic process which can occur multiple times over the lifetime of a protein, sometimes in a reciprocal relationship with phosphorylation. Several hundred proteins, which are involved in a diverse range of cellular processes, have been identified as being modified with the monosaccharide. The control of the O-GlcNAc modification state on different protein targets appears to be important in the aetiology of a number of diseases, including type II diabetes, neurodegenerative diseases and cancer. Two enzymes are responsible for the addition and removal of the O-GlcNAc modification: uridine diphospho-N-acetylglucosamine:polypeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase (OGT) and O-GlcNAcase (OGA), respectively. Over the past decade the volume of information known about these two enzymes has increased significantly. In particular, mechanistic studies of OGA, in conjunction with structural studies of bacterial homologues of OGA have stimulated the design of inhibitors and offered a rationale for the binding of certain potent and selective inhibitors. Mechanistic information about OGT lags a little way behind OGA, but the recent deduction of the structure of an OGT bacterial homologue should now drive these studies forward.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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