MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2009340526 · doi:10.1002/cbic.200690036

Cover Picture: Identification of Labile UDP‐Ketosugars in <i>Helicobacter pylori</i>, <i>Campylobacter jejuni</i> and <i>Pseudomonas aeruginosa</i>: Key Metabolites used to make Glycan Virulence Factors (ChemBioChem 12/2006)

2006· paratext· en· W2009340526 sur OpenAlexaff
David J. McNally, Ian C. Schoenhofen, Erin F. Mulrooney, Dennis M. Whitfield, Evgeny Vinogradov, Joseph S. Lam, Susan M. Logan, Jean‐Robert Brisson

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2006
Typeparatext
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensUniversity of GuelphInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCampylobacter jejuniVirulencePseudomonas aeruginosaPyranosePyocyaninMicrobiologyGlycanBacteriaBiofilmBiochemistryVirulence factorBiosynthesisMetabolic pathwayHelicobacter pyloriChemistryBiologyEnzymeQuorum sensingGlycoproteinGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cover picture shows 3D models of the pyranose rings of UDP‐sugar metabolites that were identified by examining the PseB reaction from Helicobacter pylori by using NMR spectroscopy. PseB plays an important role in the biosynthesis of pseudaminic acid (Pse)—a sialic acid‐like sugar that is found on the flagella of H. pylori. Pse is essential for bacterial motility and as such is a virulence factor. Since, it is not found in humans, agents that interfere with Pse biosynthesis could offer therapeutic potential. Several bacteria produce sugars that are attractive therapeutic targets. However, their biosynthetic pathways can involve multiple enzymatic reactions that produce unstable metabolites in minute quantities. Examination of the WbjB and WbjC reactions from Pseudomonas aeruginosa , the PglF reaction from C. jejuni and the PseB reaction from C. jejuni and H. pylori with NMR clarified biosynthetic pathways led to the identification of unstable metabolites that had not been previously observed. Further details can be found in the article by D. McNally et al. on p. 1865 ff.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueChemBioChemMême sujetCarbohydrate Chemistry and SynthesisTravaux en français237 207