Novel Microdeletions Affecting the GNAS Locus in Pseudohypoparathyroidism: Characterization of the Underlying Mechanisms
Notice bibliographique
Résumé
CONTEXT: Pseudohypoparathyroidism type Ia (PHP1A) is a rare endocrine disorder characterized by hypocalcemia, hyperphosphatemia, multiple hormonal resistance, and features of Albright hereditary osteodystrophy. When the phenotype is present but not associated with hormonal resistance, it is called psedopseudohypoparathyroidism (PPHP). Both entities have been associated to GNAS haploinsufficiency, and are mostly caused by inherited inactivating mutations at GNAS gene that codes for the stimulatory alpha subunit of G protein, although the cause remains unidentified in approximately 30% of patients. OBJECTIVES: The aims of our work were 1) to identify GNAS locus defects in 112 patients with clinical diagnosis of PHP1A/PPHP and no point mutations at GNAS, to improve molecular diagnostic and genetic counseling; 2) to outline the underlying molecular mechanism(s). METHODS: Methylation-specific-multiplex ligation-dependent probe amplification, qPCR, array comparative genomic hybridization, and long-PCR were used to search for genomic rearrangements at chromosome 20q and to identify their boundaries. We used different bioinformatic approaches to assess the involvement of the genomic architecture in the origin of the deletions. RESULTS: We discovered seven novel genomic deletions, ranging from 106-bp to 2.6-Mb. The characterization of five of seven deletion breakpoints and the definition of the putative molecular mechanisms responsible for these rearrangements revealed that Alu sequences play a major role in determining the genetic instability of the region. CONCLUSION: We observed that deletions at GNAS locus represent a significant cause of PPHP/PHP1A and that such defects are mostly associated with Alu-mediated recombination events. Their investigation revealed to be fundamental as, in some cases, they could be misdiagnosed as imprinting defects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».