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Enregistrement W2009446583 · doi:10.1371/journal.pone.0065852

Assessing Paleo-Biodiversity Using Low Proxy Influx

2013· article· en· W2009446583 sur OpenAlexafffund
Olivier Blarquez, Walter Finsinger, Christopher Carcaillet

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueGeology and Paleoclimatology Research
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la RechercheCentre National de la Recherche ScientifiqueBiodiversa+Université du Québec à ChicoutimiUniversité du Québec à Montréal
Mots-clésSpecies richnessSpecies evennessPollenBiodiversityRarefaction (ecology)EcologyPhysical geographyGeographyProxy (statistics)EcosystemEnvironmental scienceBiologyStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We developed an algorithm to improve richness assessment based on paleoecological series, considering sample features such as their temporal resolutions or their volumes. Our new method can be applied to both high- and low-count size proxies, i.e. pollen and plant macroremain records, respectively. While pollen generally abounds in sediments, plant macroremains are generally rare, thus leading to difficulties to compute paleo-biodiversity indices. Our approach uses resampled macroremain influxes that enable the computation of the rarefaction index for the low influx records. The raw counts are resampled to a constant resolution and sample volume by interpolating initial sample ages at a constant time interval using the age∼depth model. Then, the contribution of initial counts and volume to each interpolated sample is determined by calculating a proportion matrix that is in turn used to obtain regularly spaced time series of pollen and macroremain influx. We applied this algorithm to sedimentary data from a subalpine lake situated in the European Alps. The reconstructed total floristic richness at the study site increased gradually when both pollen and macroremain records indicated a decrease in relative abundances of shrubs and an increase in trees from 11,000 to 7,000 cal BP. This points to an ecosystem change that favored trees against shrubs, whereas herb abundance remained stable. Since 6,000 cal BP, local richness decreased based on plant macroremains, while pollen-based richness was stable. The reconstructed richness and evenness are interrelated confirming the difficulty to distinguish these two aspects for the studies in paleo-biodiversity. The present study shows that low-influx bio-proxy records (here macroremains) can be used to reconstruct stand diversity and address ecological issues. These developments on macroremain and pollen records may contribute to bridge the gap between paleoecology and biodiversity studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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