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Enregistrement W2009516154 · doi:10.1097/01.fpc.0000197468.16126.cd

A sensitive and rapid alternative to HLA typing as a genetic screening test for abacavir hypersensitivity syndrome

2006· article· en· W2009516154 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug-Induced Adverse Reactions
Établissements canadiensSt. Paul's Hospital
Organismes subventionnairesNational Medical Research CouncilNational Health and Medical Research Council
Mots-clésAbacavirHuman leukocyte antigenTypingPharmacogeneticsGeneticsAlleleBiologyMedicineGenotypeGeneAntigenVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Abacavir hypersensitivity reaction (ABC HSR) is a potentially life-threatening adverse reaction that affects approximately 8% of patients that initiate this antiretroviral drug. Independent groups have shown a strong predictive association between ABC HSR and HLA-B*5701, indicating that exclusion of HLA-B*5701 positive individuals from abacavir treatment would largely prevent ABC HSR. However, the limited availability and relatively high cost of human leukocyte antigen (HLA) typing represent barriers to the widespread implementation of this pharmacogenetic approach to abacavir prescribing. To facilitate routine screening, we have developed a rapid flow cytometry method for HLA-B57 phenotyping using commercially available B17 monoclonal antibodies. METHODS: Whole blood samples from 84 human immunodeficiency virus (HIV) patients were examined by standard flow cytometry methods, using a two-colour B17-specific immunofluorescence assay in the CD45 lymphocyte population. RESULTS: All eight HLA-B57 individuals examined tested positive, while HLA-B57/58 negative individuals (n=74) tested negative for this flow cytometry test. Two non-HLA-B57 individuals showed weak cross-reactivity. CONCLUSION: In our predominantly Caucasian population, B17/CD45 dual staining was sufficient to identify individuals carrying B17 cell surface antigens. This approach, utilizing flow cytometry methods that are widely available in HIV laboratories, therefore offers a sensitive, rapid and cost-effective screening assay prior to abacavir prescription. Following risk stratification with this assay, it would be anticipated that identification of HLA-B*5701 using molecular HLA typing methods would be required in <10% of the screened population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,477
Score d'incertitude au seuil0,967

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle