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Enregistrement W2009663868 · doi:10.1139/z01-193

Mitochondrial DNA sequence variation and the specific identification of deer mice (<i>Peromyscus</i>) from Triangle Island, British Columbia, Canada

2001· article· en· W2009663868 sur OpenAlexvenueaboutno aff
Scott E. Chirhart, Roozbeh Arianpour, Rodney L. Honeycutt, Ira F. Greenbaum

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Zoology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésPeromyscusBiologyDeer mouseMitochondrial DNAPhylogenetic treePopulationGenetic distanceZoologyGeneticsGenetic variationGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nucleotide sequences from the ND3, ND4L, and ND4 genes of the mitochondrial DNA of deer mice (Peromyscus) from Triangle Island, British Columbia, were analyzed and compared with those from reference samples of the geographically proximal species Peromyscus maniculatus and Peromyscus keeni. Variation among the deer mice from Triangle Island comprised four sequences with a total sequence divergence of 0.093%. One of these sequences characterized 52% of the 27 individuals analyzed; each of the other sequence variants occurred in smaller, but similar, proportions of the population sample. Phylogenetic and distance-clustering analyses uniformly grouped the sequences from the Triangle Island population and placed them within a cluster otherwise comprised of the P. keeni reference samples. The reference samples of P. maniculatus clustered distinctly and significantly outside of the P. keeni/Triangle Island deer mouse assemblage. These data indicate that, in contradiction to their current formal recognition as P. maniculatus, the deer mice from Triangle Island are representative of, and should be taxonomically relegated to, P. keeni.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,255
Score d'incertitude au seuil0,512

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,178
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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