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Enregistrement W2009682500 · doi:10.1016/j.ijantimicag.2012.05.009

Raloxifene attenuates Pseudomonas aeruginosa pyocyanin production and virulence

2012· article· en· W2009682500 sur OpenAlexaff
Shannan J. Ho Sui, Raymond Lo, Aalton R. Fernandes, Mackenzie D.G. Caulfield, Joshua A. Lerman, Lei Xie, Philip E. Bourne, David L. Baillie, Fiona S. L. Brinkman

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Antimicrobial Agents · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésPyocyaninPseudomonas aeruginosaVirulenceRaloxifeneMicrobiologyPathogenBiofilmBiologyQuorum sensingGeneBacteriaCancerBiochemistryGeneticsEstrogen receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There has been growing interest in disrupting bacterial virulence mechanisms as a form of infectious disease control through the use of 'anti-infective' drugs. Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen noted for its intrinsic antibiotic resistance that causes serious infections requiring new therapeutic options. In this study, an analysis of the P. aeruginosa PAO1 deduced proteome was performed to identify pathogen-associated proteins. A computational screening approach was then used to discover drug repurposing opportunities, i.e. identifying approved drugs that bind and potentially disrupt the pathogen-associated protein targets. The selective oestrogen receptor modulator raloxifene, a drug currently used in the prevention of osteoporosis and/or invasive breast cancer in post-menopausal women, was predicted from this screen to bind P. aeruginosa PhzB2. PhzB2 is involved in production of the blue pigment pyocyanin produced via the phenazine biosynthesis pathway. Pyocyanin is toxic to eukaryotic cells and has been shown to play a role in infection in a mouse model, making it an attractive target for anti-infective drug discovery. Raloxifene was found to strongly attenuate P. aeruginosa virulence in a Caenorhabditis elegans model of infection. Treatment of P. aeruginosa wild-type strains PAO1 and PA14 with raloxifene resulted in a dose-dependent reduction in pyocyanin production in vitro; pyocyanin production and virulence were also reduced for a phzB2 insertion mutant. These results suggest that raloxifene may be suitable for further development as a therapeutic for P. aeruginosa infection and that such already approved drugs may be computationally screened and potentially repurposed as novel anti-infective/anti-virulence agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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