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Enregistrement W2009696885 · doi:10.1371/journal.pone.0111986

The Feasibility of the Interferon Gamma Release Assay and Predictors of Discordance with the Tuberculin Skin Test for the Diagnosis of Latent Tuberculosis Infection in a Remote Aboriginal Community

2014· article· en· W2009696885 sur OpenAlexafffundabout
Gonzalo G. Alvarez, Deborah D. Van Dyk, Naomi Davies, Shawn D. Aaron, D. William Cameron, Marc Desjardins, Ranjeeta Mallick, Natan Obed, Maureen Baikie

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensGovernment of NunavutUniversity of OttawaNunavut Research InstituteOttawa Hospital
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésMedicineTuberculinInterferon gamma release assayTuberculosisLatent tuberculosisVaccinationPopulationBCG vaccineImmunologyQuantiFERONMycobacterium tuberculosisInternal medicineTuberculosis diagnosisEnvironmental healthPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The tuberculin skin test (TST) is the standard test used to screen for latent TB infection (LTBI) in the northern Canadian territory of Nunavut. Interferon gamma release assays (IGRA) are T cell blood-based assays to diagnose LTBI. The Bacillus Calmette-Guerin (BCG) vaccine is part of the routine immunization schedule in Nunavut. The objective of this study was to test the feasibility, and predictors of discordance between the Tuberculin Skin Test (TST) and the IGRA assay in a medically under-serviced remote arctic Aboriginal population. METHODS: Both the TST and QuantiFERON-TB Gold (Qiagen group) IGRA tests were offered to people in their homes as part of a public health campaign aimed at high TB risk residential areas in Iqaluit, Nunavut, Canada. Feasibility was measured by the capacity of the staff to do the test successfully as measured by the proportion of results obtained. RESULTS: In this population of predominantly young Inuit who were mostly BCG vaccinated, the use of IGRA for the diagnosis of LTBI was feasible. IGRA testing resulted in more available test results reaching patients (95.6% vs 90.9% p = 0.02) but took longer (median 8 days (IGRA) vs 2 days (TST), p value < 0.0001). 44/256 participants (17.2%) had discordant results. Multivariable regression analysis suggested that discordant results were most likely to have received multiple BCG vaccinations (RR 20.03, 95% CI, 3.94-101.82)), followed by BCG given post infancy (RR 8.13, 95% CI, 2.54-26.03)) and then to a lesser degree when BCG was given in infancy (RR 6.43, 95% CI, 1.72-24.85). INTERPRETATION: IGRA is feasible in Iqaluit, Nunavut, a remote Arctic community. IGRA testing results in more test results available to patients compared to TST. This test could result in fewer patients requiring latent TB treatment among those previously vaccinated with BCG in a region with limited public health human resources.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,193

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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