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Enregistrement W2009742672 · doi:10.1523/jneurosci.5295-08.2009

A Ca <sub>v</sub> 3.2 T-Type Calcium Channel Point Mutation Has Splice-Variant-Specific Effects on Function and Segregates with Seizure Expression in a Polygenic Rat Model of Absence Epilepsy

2009· article· en· W2009742672 sur OpenAlexafffund
Kim L. Powell, Stuart M. Cain, Caroline L. Ng, Shreerang Sirdesai, Laurence S. David, Mervyn Kyi, Esperanza Garcı́a, John R. Tyson, Christopher A. Reid, Melanie Bahlo, Simon J. Foote, Terrance P. Snutch, Terence J. O’Brien

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchJames S. McDonnell Foundation
Mots-clésPoint mutationspliceFunction (biology)MutationCalcium channelGeneticsAlternative splicingBiologyExpression (computer science)NeuroscienceMolecular biologyCell biologyCalciumChemistryGeneExonComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Low-voltage-activated, or T-type, calcium (Ca(2+)) channels are believed to play an essential role in the generation of absence seizures in the idiopathic generalized epilepsies (IGEs). We describe a homozygous, missense, single nucleotide (G to C) mutation in the Ca(v)3.2 T-type Ca(2+) channel gene (Cacna1h) in the genetic absence epilepsy rats from Strasbourg (GAERS) model of IGE. The GAERS Ca(v)3.2 mutation (gcm) produces an arginine to proline (R1584P) substitution in exon 24 of Cacna1h, encoding a portion of the III-IV linker region in Ca(v)3.2. gcm segregates codominantly with the number of seizures and time in seizure activity in progeny of an F1 intercross. We have further identified two major thalamic Cacna1h splice variants, either with or without exon 25. gcm introduced into the splice variants acts "epistatically," requiring the presence of exon 25 to produce significantly faster recovery from channel inactivation and greater charge transference during high-frequency bursts. This gain-of-function mutation, the first reported in the GAERS polygenic animal model, has a novel mechanism of action, being dependent on exonic splicing for its functional consequences to be expressed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations189
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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