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Enregistrement W2009788754 · doi:10.1074/jbc.m207797200

Novel Topology in C-terminal Region of the Human Plasma Membrane Anion Exchanger, AE1

2003· article· en· W2009788754 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of AlbertaCanadian Institutes of Health Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAnion exchangerTerminal (telecommunication)Topology (electrical circuits)MembraneIon exchangeIonPlasmaChemistryPhysicsComputer scienceEngineeringBiochemistryComputer networkElectrical engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human AE1 performs electroneutral exchange of Cl(-) for HCO(3)(-) across the erythrocyte membrane. We examined the topology of the AE1 C-terminal region using cysteine-scanning mutagenesis and sulfhydryl-specific chemistry. Eighty individual cysteine residues, introduced into an otherwise cysteine-less mutant between Phe(806) and Cys(885), were expressed by transient transfection of HEK293 cells. Topology of the region was determined by comparing cysteine labeling with the membrane-permeant cysteine-directed reagent biotin maleimide, with or without prior labeling with the membrane-impermeant reagents, bromotrimethylammoniumbimane bromide (qBBr) and lucifer yellow iodoacetamide (LYIA). Phe(806)-Leu(835), Ser(852)-Ala(855), and Ile(872)-Cys(885) were labeled by biotin maleimide, suggesting their location in an aqueous environment. In contrast, Phe(836)-Lys(851) and Ser(856)-Arg(871) were not labeled by biotin maleimide and therefore localize to the plane of the bilayer, as transmembrane segments (TM). Labeling by qBBr revealed that Pro(815)-Lys(829) and Ser(852)-Ala(855) are accessible to the extracellular medium. Pro(815)-Lys(829) mutants were also labeled with LYIA. Mutants Ile(872)-Cys(885) were inaccessible to the extracellular medium and thus localized to the intracellular surface of AE1. Functional assays revealed that one face of each of two AE1 TMs was sensitive to mutation. Based on these results, we propose a topology model for the C-terminal region of the membrane domain of human AE1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,245

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle