Bimodal regulation of <i>mPeriod</i> promoters by CREB-dependent signaling and CLOCK/BMAL1 activity
Notice bibliographique
Résumé
Circadian rhythmicity in mammals is under the control of a molecular pacemaker constituted of clock gene products organized in transcriptional autoregulatory loops. Phase resetting of the clock in response to light involves dynamic changes in the expression of several clock genes. The molecular pathways used by light to influence pacemaker-driven oscillation of clock genes remain poorly understood. We explored the functional integration of both light- and clock-responsive transcriptional regulation at the promoter level of the Period (Per) genes. Three Per genes exist in the mouse. Whereas mPer1 and mPer2 are light-inducible in clock neurons of the hypothalamic suprachiasmatic nucleus, mPer3 is not. We have studied the promoter structure of the three mPer genes and compared their regulation. All three mPer promoters contain E-boxes and respond to the CLOCK/brain and muscle aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator (ARNT)-like protein 1 (BMAL1) heterodimer. On the other hand, only mPer1 and mPer2 promoters contain bona fide cAMP-responsive elements (CREs) that bind CRE-binding protein (CREB) from suprachiasmatic nucleus protein extracts. The mPer1 promoter is responsive to synergistic activation of the cAMP and mitogen-activated protein kinase pathways, a physiological response that requires integrity of the CRE. In contrast, activation of mPer promoters by CLOCK/BMAL1 occurs regardless of an intact CRE. Altogether, these results constitute strong evidence that CREB acts as a pivotal endpoint of signaling pathways for the regulation of mPer genes. Our results reveal that signaling-dependent activation of mPer genes is distinct from the CLOCK/BMAL1-driven transcription required within the clock feedback loop.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».