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Enregistrement W2009880584 · doi:10.1074/jbc.m109.051201

Ligand-dependent Corepressor LCoR Is an Attenuator of Progesterone-regulated Gene Expression

2009· article· en· W2009880584 sur OpenAlexafffund
Ana Palijan, Isabelle Fernandes, Mark Verway, Maria Kourelis, Yolande Bastien, Luz E. Tavera-Mendoza, Aaron Sacheli, Véronique Bourdeau, Sylvie Mader, John H. White

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueKruppel-like factors research
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and CancerMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCorepressorAttenuator (electronics)Cell biologyGene expressionChemistryProgesterone receptorLigand (biochemistry)GeneBiologyRepressorReceptorGeneticsBiochemistryPhysicsEstrogen receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ligand-dependent corepressor LCoR interacts with the progesterone receptor (PR) and estrogen receptor ERalpha in the presence of hormone. LCoR contains tandem N-terminal PXDLS motifs that recruit C-terminal-binding protein (CtBP) corepressors as well as a C-terminal helix-turn-helix (HTH) domain. Here, we analyzed the function of these domains in coregulation of PR- and ERalpha-regulated gene expression. LCoR and CtBP1 colocalize in nuclear bodies that also contain CtBP-interacting protein CtIP and polycomb group repressor complex marker BMI1. Coexpression of CtBP1 in MCF7 or T47D breast cancer cells augmented corepression by LCoR, whereas coexpression of CtIP did not, consistent with direct interaction of LCoR with CtBP1, but not CtIP. The N-terminal region containing the PXDLS motifs is necessary and sufficient for CTBP1 recruitment and essential for full corepression. However, LCoR function was also strongly dependent on the helix-turn-helix domain, as its deletion completely abolished corepression. LCoR, CtBP, and CtIP were recruited to endogenous PR- and ERalpha-stimulated genes in a hormone-dependent manner. Similarly, LCoR was recruited to estrogen-repressed genes, whereas hormone treatment reduced CtBP1 binding. Small interfering RNA-mediated knockdown of LCoR or CtBP1 augmented expression of progesterone- and estrogen-stimulated reporter genes as well as endogenous progesterone-stimulated target genes. In contrast, their ablation had gene-specific effects on ERalpha-regulated transcription that generally led to reduced gene expression. Taken together, these results show that multiple domains contribute to LCoR function. They also reveal a role for LCoR and CtBP1 as attenuators of progesterone-regulated transcription but suggest that LCoR and CtBP1 can act to enhance transcription of some genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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