An Approach to Whole-Genome Identification of IRES Elements
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Spatial and temporal control of proteome expression is critical for cellular homeostasis. The ability to regulate polypeptide synthesis allows the cell to rapidly respond to changes in its environment. Under stress conditions, capdependent translation initiation is downregulated and alternative mechanisms of translation initiation are favoured for the production of critical proteins that ultimately determine whether the cell is able to overcome the stress. One such alternative mechanism of translation initiation is mediated by sequence elements located downstream of the 5 cap structure that are able to directly recruit ribosomes to a region proximal to the translation start site. Identifying the eukaryotic mRNAs that contain such internal ribosome entry sites (IRESes) is an important first step in cataloguing the cellular complement of proteins whose expression is translationally regulated during cellular stress and understanding how cells regulate translation under stress conditions. To date, no consensus sequence motif or structure has been identified as a signature of cellular IRES activity, making it difficult to identify the full complement of eukaryotic IRESes. This review will underscore the challenges faced in identifying IRESes on a genomic scale and potential solutions will be presented. Keywords: IRES, translation, stress, differentiation, microarray, polysome
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle