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Enregistrement W2010055412 · doi:10.1021/am507466b

Acceleration of Proteolytic Activity Associated with Selection of Thiol Ligand Coatings on Quantum Dots

2015· article· en· W2010055412 sur OpenAlexafffund
Miao Wu, W. Russ Algar

Notice bibliographique

RevueACS Applied Materials & Interfaces · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueQuantum Dots Synthesis And Properties
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsMichael Smith Health Research BCUniversity of California, San FranciscoCanada Foundation for Innovation
Mots-clésThiolMaterials scienceLigand (biochemistry)AccelerationQuantum dotSelection (genetic algorithm)NanotechnologyChemical physicsChemical engineeringOrganic chemistryChemistryComputer scienceQuantum mechanicsBiochemistryPhysicsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nanoparticle bioconjugates are attractive probes for measuring the activity of hydrolytic enzymes. In these configurations, the localization of multiple copies of a hydrolase substrate to a nanoparticle scaffold has been reported to enhance apparent activity by factors of 2 to 3 compared to that for equivalent amounts of substrate in bulk solution. Here, we studied the effect of surface chemistry on protease activity using multivalent QD-peptide substrate conjugates as a model system. QDs were coated with cysteine (CYS), glutathione (GSH), dihydrolipoic acid (DHLA), or 3-mercaptopropionic acid (MPA) ligands, and thrombin and trypsin were used as model proteases. Proteolytic activity was measured for different combinations of ligand and protease using Förster resonance energy transfer (FRET)-based assays. The highest levels of activity were observed with CYS and GSH coatings, and the lowest levels of activity were observed with DHLA and MPA coatings. In all cases, proteolytic activity was accelerated compared to that for an equivalent amount of substrate in bulk solution, with up to 80- and 65-fold increases in the apparent specificity constants for thrombin and trypsin, respectively. Thrombin was more strongly affected by the QD surface chemistry, with up to a 50-fold variation in its apparent specificity constant between ligand coatings, whereas only a 5-fold variation was observed with trypsin. These trends were correlated to adsorption of the proteases on the QDs and are discussed in the context of the physicochemical properties of both components. This work clearly indicates a critical role for the nanoparticle interface in mediating substrate turnover and provides some of the strongest support to date for a so-called hopping model of activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,626

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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