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Enregistrement W2010080579 · doi:10.1089/dna.2011.1351

Crosstalk Between the <i>FGFR2</i> and <i>TP53</i> Genes in Breast Cancer: Data from an Association Study and Epistatic Interaction Analysis

2011· article· en· W2010080579 sur OpenAlex
Н. В. Чердынцева, Evgeny V. Denisov, Н. В. Литвяков, В. Н. Максимов, Elena Malinovskaya, Е. М. Slonimskaya, М. И. Воевода, Е. Л. Чойнзонов

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueDNA and Cell Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFibroblast Growth Factor Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of CalgaryDartmouth College
Mots-clésBiologyEpistasisMultifactor dimensionality reductionBreast cancerLocus (genetics)GenotypeEstrogen receptorCrosstalkFibroblast growth factor receptor 2GeneOncologyGeneticsCancer researchInternal medicineCancerSingle-nucleotide polymorphismReceptorFibroblast growth factorMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To evaluate the potential for gene-gene interaction effects in sporadic breast cancer (BC) risk, we studied combinations of the fibroblast growth factor receptor 2 (FGFR2) rs1219648 and tumor protein 53 (TP53) rs1042522, rs1625895, and rs17878362 polymorphisms in BC patients (n=388) and healthy persons (n=275). In addition to a single-locus effect manifested by the association of FGFR2 rs1219648 and TP53 rs1042522 polymorphisms with high BC risk, depending on menopause status (0.001<p<0.05), we showed a highly significant cooperation between the examined polymorphisms in FGFR2 and TP53 in the determination of susceptibility to the disease. Indeed, we found that combinations of FGFR2 minor and TP53 major genotypes were associated with a high risk of BC, particularly in the postmenopausal period (0.01<p<0.05). In contrast, combinations of the FGFR2 and TP53 major genotypes had a protective effect against BC, especially in premenopausal women (0.001<p<0.01). Of note, all observations were estrogen receptor (ER) dependent. The significant crosstalk between FGFR2 and TP53 polymorphisms was also confirmed by multifactor dimensionality reduction and ordered combinatorial partitioning approaches (0.001<p<0.05). Taken together, data from the present study demonstrate the age- and ER-specific interplay between TP53 and FGFR2 in BC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,155
Score d'incertitude au seuil0,741

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle