High Cationic Charge and Bilayer Interface-Binding Helices in a Regulatory Lipid Glycosyltransferase<sup>,</sup>
Notice bibliographique
Résumé
In the prokaryote Acholeplasma laidlawii, membrane bilayer properties are sensed and regulated by two interface glycosyltransferases (GTs), synthesizing major nonbilayer- (alMGS GT) and bilayer-prone glucolipids. These enzymes are of similar structure, as many soluble GTs, but are sensitive to lipid charge and curvature stress properties. Multivariate and bioinformatic sequence analyses show that such interface enzymes, in relation to soluble ones of similar fold, are characterized by high cationic charge, certain distances between small and cationic amino acids, and by amphipathic helices. Varying surface contents of Lys/Arg pairs and Trp indicate different membrane-binding subclasses. A predicted potential (cationic) binding helix from alMGS was structurally verified by solution NMR and CD. The helix conformation was induced by a zwitterionic as well as anionic lipid environment, and the peptide was confined to the bilayer interface. Bilayer affinity of the peptide, analyzed by surface plasmon resonance, was higher than that for soluble membrane-seeking proteins/peptides and rose with anionic lipid content. Interface intercalation was supported by phase equilibria in membrane lipid mixtures, analyzed by 31P NMR and DSC. An analogous, potentially binding helix has a similar location in the structurally determined Escherichia coli cell wall precursor GT MurG. These two helices have little sequence conservation in alMGS and MurG homologues but maintain their amphipathic character. The evolutionary modification of the alMGS binding helix and its location close to the acceptor substrate site imply a functional importance in enzyme catalysis, potentially providing a mechanism by which glycolipid synthesis will be sensitive to membrane surface charge and intrinsic curvature strain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».