Prospective Validation Obtained in a Similar Group of Patients and with Similar High Throughput Biological Tests Failed to Confirm Signatures for Prediction of Response to Chemotherapy and Survival in Advanced NSCLC: A Prospective Study from the European Lung Cancer Working Party
Notice bibliographique
Résumé
AIM: Cisplatin doublets are standard 1st line treatment for advanced non-small cell lung cancer (NSCLC), without accurate predictor for response and survival, but important toxicity. Our aims were to identify predictive (for response) and prognostic (for survival) biological signatures in patients with NSCLC using messenger RNAs (mRNA) and miRNA expression. METHODS: Patients with pathologically proven untreated NSCLC, receiving 1st line cisplatin-vinorelbine and with an assessable lesion were eligible. A bronchial biopsy was lysed into Tripure Isolation Reagent on ice, snap frozen, and stored at -80°C. mRNA expression was analyzed using microarrays Agilent Technologies. miRNA expression was assessed using TaqMan Low Density Arrays (756 human miR panel, Applied Biosystems). Validation was performed by RT-PCR on the selected genes. Survival was measured from the registration date and response assessed by WHO criteria. RESULTS: Biopsies for transcriptomic analyses were obtained from 60 consecutive patients. No statistically significant differences were observed according to the main clinical characteristics, response rate (43 vs. 41%) or survival (median 25 vs. 29 months) between derivation and validation sets. In the derivation set (n = 38 patients), two mRNA and one miRNA predictive signatures for response were obtained. One mRNA and one miRNA prognostic signatures were derived from the first set, allowing an adequate distinction of patients with good and poor overall and progression-free survivals. None of these signatures could be validated in the validation set (n = 22 patients). CONCLUSION: In this prospective study with advanced NSCLC treated with cisplatin-vinorelbine, we were able to derive with high throughput techniques predictive and prognostic signatures based on transcriptomic analyses. However, these results could not be reproduced in an independent validation set. The role of miRNA and mRNA as predictive or prognostic factors remains a research topic and the use of high throughput technology in that context questionable. The ClinicalTrials.gov study identifier is NCT00864266 (www.clinicaltrials.gov).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».