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Enregistrement W2010238780 · doi:10.1074/jbc.m203661200

Endocytic Intermediates Involved with the Intracellular Trafficking of a Fluorescent Cellular Prion Protein

2002· article· en· W2010238780 sur OpenAlexaff
Ana C. Magalhães, Juliana Silva, Kil Sun Lee, Vilma R. Martins, Vânia F. Prado, Stephen Ferguson, Marcus V. Gomez, Helena Brentani, Marco A. M. Prado

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndocytic cycleIntracellularCell biologyChemistryFluorescencePrion proteinBiologyEndocytosisBiochemistryCellMedicinePathologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have investigated the intracellular traffic of PrP(c), a glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored protein implicated in spongiform encephalopathies. A fluorescent functional green fluorescent protein (GFP)-tagged version of PrP(c) is found at the cell surface and in intracellular compartments in SN56 cells. Confocal microscopy and organelle-specific markers suggest that the protein is found in both the Golgi and the recycling endosomal compartment. Perturbation of endocytosis with a dynamin I-K44A dominant-negative mutant altered the steady-state distribution of the GFP-PrP(c), leading to the accumulation of fluorescence in unfissioned endocytic intermediates. These pre-endocytic intermediates did not seem to accumulate GFP-GPI, a minimum GPI-anchored protein, suggesting that PrP(c) trafficking does not depend solely on the GPI anchor. We found that internalized GFP-PrP(c) accumulates in Rab5-positive endosomes and that a Rab5 mutant alters the steady-state distribution of GFP-PrP(c) but not that of GFP-GPI between the plasma membrane and early endosomes. Therefore, we conclude that PrP(c) internalizes via a dynamin-dependent endocytic pathway and that the protein is targeted to the recycling endosomal compartment via Rab5-positive early endosomes. These observations indicate that traffic of GFP-PrP(c) is not determined predominantly by the GPI anchor and that, different from other GPI-anchored proteins, PrP(c) is delivered to classic endosomes after internalization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations123
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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