Comparison of E1A CR3-Dependent Transcriptional Activation across Six Different Human Adenovirus Subgroups
Notice bibliographique
Résumé
The largest E1A isoform of human adenovirus (Ad) includes a C-4 zinc finger domain within conserved region 3 (CR3) that is largely responsible for activating transcription of the early viral genes. CR3 interacts with multiple cellular factors, but its mechanism of action is modeled primarily on the basis of the mechanism for the prototype E1A protein of human Ad type 5. We expanded this model to include a representative member from each of the six human Ad subgroups. All CR3 domains tested were capable of transactivation. However, there were dramatic differences in their levels of transcriptional activation. Despite these functional variations, the interactions of these representative CR3s with known cellular transcriptional regulators revealed only modest differences. Four common cellular targets of all representative CR3s were identified: the proteasome component human Sug1 (hSug1)/S8, the acetyltransferases p300/CREB binding protein (CBP), the mediator component mediator complex subunit 23 (MED23) protein, and TATA binding protein (TBP). The first three factors appear to be critical for CR3 function. RNA interference against human TBP showed no significant reduction in transactivation by any CR3 tested. These results indicate that the cellular factors previously shown to be important for transactivation by Ad5 CR3 are similarly bound by the E1A proteins of other types. This was confirmed experimentally using a transcriptional squelching assay, which demonstrated that the CR3 regions of each Ad type could compete with Ad5 CR3 for limiting factors. Interestingly, a mutant of Ad5 CR3 (V147L) was capable of squelching wild-type Ad5 CR3, despite its failure to bind TBP, MED23, p300/CBP-associated factor (pCAF), or p300/CBP, suggestive of the possibility that an additional as yet unidentified cellular factor is required for transactivation by E1A CR3.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».