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Enregistrement W2010324246 · doi:10.1139/w10-085

Carbon utilization profiles of Fusarium virguliforme isolates

2010· article· en· W2010324246 sur OpenAlexvenueno aff
Elizabeth Tang, Camilla Beate Hill, G. L. Hartman

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMyceliumSalicinCellobioseCarbon fibersBiomass (ecology)BotanyFood scienceEcologyMathematicsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium virguliforme is the cause of sudden death syndrome in soybean. Physiological variability among isolates of the fungus is unknown. One way to measure physiologic variability is to analyze growth on different carbon sources. The carbon source utilization profiles of 18 F. virguliforme isolates were examined using the Biolog FF 96-well microplate, which contains 95 different carbon sources. The utilization of dextrin,D-mannitol, maltotriose,D-lactic acid methyl ester, N-acetyl-D-galactosamine, salicin, D-trehalose, and L-alanine differed significantly among isolates (P = 0.05). Carbon sources were grouped into 3 clusters based on their ability to promote growth of F. virguliforme, after calculating Euclidean distances among them. About 12% of the carbon sources promoted a high amount of mycelial growth, 39% promoted a medium amount of growth, and 49% promoted a low amount of mycelial growth; the latter was not significantly different from the water blank control. A hierarchical tree diagram was produced for the 18 isolates based on their carbon source utilization profiles using Ward's hierarchical analysis method. Two main clusters of isolates were formed. One cluster represented greater average mycelial growth on all of the carbon sources than the other cluster. In this study, variability in carbon source utilization among F. virguliforme isolates was evident, but the results were not associated with geographic origin of the isolates, year collected, or published data on aggressiveness. Additional research is needed to determine if these carbon utilization profiles are associated with other biological characteristics, like spore germination, propagule formation, and saprophytic competitiveness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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