Analysis of the IDS Gene in 38 Patients with Hunter Syndrome: The c.879G>A (p.Gln293Gln) Synonymous Variation in a Female Create Exonic Splicing
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Hunter syndrome (mucopolysaccharidosis type II, MPS II) is a rare disease inherited in an X-linked autosomal recessive pattern. It is the prevailing form of the mucopolysaccharidoses in China. Here we investigated mutations of IDS (iduronate 2-sulfatase) gene in 38 unrelated Chinese patients, one of which is a female. METHODS: Peripheral leucocytes were collected from the patients and the IDS gene was amplified to looking for the variations. For a female patient, the X chromosome status was analyzed by androgen receptor X-inactivation assay and the mutation impact on RNA level was further performed by reverse transcription polymerase chain reaction. RESULTS: We discovered that point mutations constituted the major form while mutations in codon p.R468 defined the largest number of patients in our cohort. Consistent with data from other ethnic groups, exons 9 and 3 had comparatively more mutations, while exon 2 had quite a few mutations unique to Chinese patients. Of the 30 different mutations identified, only 9 were novel: one was a premature termination mutation, i.e., c.196C>T (p.Gln66X); three were missense mutations, i.e., c.200T>C (p.Leu67Pro), c.215T>C (p.Leu72Pro), c.389C>T (p.Thr130Ile); one was a small deletion, i.e., c.1104_1122del19 (p.Ser369ArgfsX16); and one was a deletion that spanned both exons 8 and 9 deletion leading to gross structural changes in the IDS gene. In addition, a synonymous mutation c.879G>A (p.Gln293Gln) was identified in a female Hunter disease patient, which resulted in loss of the original splicing site, activated a cryptic splicing site upstream, leading to a 28 bp deletion and a premature termination at p. Tyr285GlufsX47. Together with concurrent skewed X-inactivation this was believed to facilitate the development of Hunter disease in this girl. CONCLUSIONS: In conclusion, the molecular analysis of IDS gene in Chinese patients confirmed the Hunter disease diagnosis and expanded the mutation and clinical spectrum of this devastating disorder.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».