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Enregistrement W2010492098 · doi:10.1136/jcp.2006.039552

Prognostic significance of mucins in colorectal cancer with different DNA mismatch-repair status

2006· article· en· W2010492098 sur OpenAlexaff
Andrea Kopp Lugli, Inti Zlobec, Kristi Baker, Parham Minoo, Luigi Tornillo, Luigi Terracciano, J R Jass

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNovartis Foundation
Mots-clésColorectal cancerMedicineMucin 2MLH1MucinTissue microarrayMUC1OncologyInternal medicineDNA mismatch repairImmunohistochemistryCancerPathologyBiologyGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Expression of mucin antigen MUC1 and down regulation of MUC2 are associated with adverse prognosis in colorectal cancer (CRC), but their prognostic significance with respect to differing DNA mis- match repair (MMR) status is poorly understood. OBJECTIVE: To determine the prognostic significance of MUC1 and MUC2 in CRC with different MMR statuses. METHODS: Using the tissue microarray (TMA) technique, a series of 1420 unselected, non-consecutive CRC resections was subdivided into three groups: (1) MMR-proficient; (2) MLH1-negative; and (3) presumed hereditary non-polyposis colon cancer (HNPCC). Immunohistochemical analysis of MUC1 and MUC2 expression (>0%) and loss (0%) was performed, and the results were correlated with clinicopathological parameters. RESULTS: In MMR-proficient CRC, MUC1 expression was more frequently found in tumours with higher tumour stage (p=0.004) and higher tumour grade (p=0.041) and loss of MUC2 was associated with higher tumour stage (p=0.028), node stage (p=0.001), presence of vascular invasion (p=0.028) and worse survival (p=0.034). In MLH1-negative CRC, MUC2 loss was associated with the presence of lymph node metastasis (p=0.028) and worse survival (p=0.015), but there was no association between MUC1 expression and clinicopathological features. In presumed HNPCC, MUC1 expression and MUC2 loss were not associated with clinicopathological parameters. CONCLUSIONS: Mucins have a prognostic significance in sporadic CRC, but not in hereditary CRC. Loss of MUC2 is an adverse prognostic factor in MMR-proficient and MLH1-negative CRC, whereas MUC1 expression is associated with tumour progression in MMR-proficient CRC only.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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