Amplified fragment length polymorphism and mitochondrial sequence data detect genetic differentiation and relationships in endangered southwestern U.S.A. ambersnails (<i>Oxyloma</i> spp.)
Notice bibliographique
Résumé
Le gastropode Oxyloma haydeni kanabensis est sur la liste federale des especes menacees de mollusques et il habite en deux endroits dans le sud-ouest des Etats-Unis. Pour determiner l'ampleur de la variation genetique au sein des populations et entre les populations de ce taxon, nous avons procede a la technique du polymorphisme de la longueur des fragments amplifies (AFLP) pour generer 110 marqueurs genetiques parmi les individus echantillonnes dans les populations d'O. h. kanabensis et des deux seules populations connues d'Oxyloma haydeni haydeni du Utah et du nord de l'Arizona. Des informations additionnelles ont ete obtenues a partir de donnees sur les sequences des fragments des genes cytochrome b et cytochrome oxydase I. Les resultats indiquent des differences importantes entre les populations, comme l'ont revele les techniques de regroupement UPGMA, les valeurs de F et le test de Fisher. Divers niveaux de diversite genetique ont ete observes au sein de chaque population. L'heterozygotie theorique se situait entre 0,239 et 0,086 d'apres un modele base sur les proportions genotypiques Hardy-Weinberg, et se situait entre 0,205 et 0,061 d'apres un modele a autofecondation obligee completement homozygote. Les resultats des analyses de groupements indiquent qu'une population d'O. h. kanabensis et une population d'O. h. haydeni sont tres semblables que les deux populations etudier d'O. h. kanabensis (d'apres plus de 80 % de bootstraps repetes). Ces resultats sont de plus confirmes par une analyse phylogenetique des deux fragments de genes mitochondriaux. Nos donnees semblent indiquer que les appellations taxonomiques necessitent d'etre revisees, un processus qui affectera sans doute le statut protege de certaines des populations.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».