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Enregistrement W2010507429 · doi:10.1128/jvi.00183-07

Binding of Kaposi's Sarcoma-Associated Herpesvirus K-bZIP to Interferon-Responsive Factor 3 Elements Modulates Antiviral Gene Expression

2007· article· en· W2010507429 sur OpenAlexafffund
Sylvain Lefort, Anton Soucy-Faulkner, Nathalie Grandvaux, Louis Flamand

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Saint-LucUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanada Research Chairs
Mots-clésBiologybZIP domainTransactivationATF3PromoterTranscription factorActivating transcription factorMolecular biologyActivating transcription factor 2Regulation of gene expressionActivator (genetics)Interferon regulatory factorsGene expressionGeneLeucine zipperGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus encodes numerous regulatory proteins capable of modulating viral and cellular gene expression and affecting host cell functions. K-bZIP, a leucine zipper-containing transcription factor encoded by ORFK8, is one such protein. During infection, transcription of the ORFK8 early gene is turned on by the immediate-early replication and transcription factor activator (RTA). One described function of the K-bZIP nuclear protein is to interact with and repress RTA-mediated transactivation of viral promoters, including that of the K8 gene. In the present work, we provide evidence that the expression of K-bZIP results in the activation of the ifn-beta gene. Of interest, ifn-beta gene activation by K-bZIP is independent of interferon (IFN)-responsive factor 3 (IRF-3) and nuclear factor kappaB (NF-kappaB) activation. Using a DNA binding affinity assay and electromobility shift assay, we report that K-bZIP binds efficiently to the PRDIII-I region of the beta IFN (IFN-beta) promoter, and, in doing so, it prevents the attachment of activated IRF-3 but not that of NF-kappaB or ATF2/c-Jun to the IFN-beta promoter sequence. As a consequence, ifn-beta gene activation in response to IFN inducers such as Sendai virus infection or expression of retinoic acid-inducible gene I, mitochondrial antiviral signaling protein, or TANK-binding kinase 1 (TBK-1) is severely impaired (>90%) by the presence of K-bZIP. K-bZIP also prevents the activation of RANTES and CXCL11, whose promoters are also regulated by IRF-3. Lysine 158 (target for SUMO conjugation), threonine 111, and serine 167 (targets for phosphorylation) mutants of K-bZIP were equally effective as wild-type K-bZIP in mediating the repression of TBK-1-activated ifn-beta gene expression. Lastly, the overexpression of CREB binding protein could not reverse the K-bZIP repression of TBK-1-activated ifn-beta gene expression. In all, our results indicate that K-bZIP binds directly to the PRDIII-I region of the IFN-beta promoter and, as a consequence, causes a low level of ifn-beta gene transcription. In doing so, K-bZIP prevents IRF-3 from binding to the IFN-beta promoter and precludes the formation of the enhanceosome, which is required for maximal ifn-beta gene transcription. A new role for K-bZIP as a protein involved in immune evasion is therefore uncovered.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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