cDNA cloning, biochemical and phylogenetic characterization of β‐ and β′‐subunits of <i>Candida albicans</i> protein kinase CK2
Notice bibliographique
Résumé
We have previously reported that Candida albicans protein kinase CK2 is composed of two distinct catalytic (alpha- and alpha'-) and two distinct regulatory (beta- and beta'-) subunits. We report here the isolation of two cDNAs clones, CaCKB1 and CaCKB2, encoding C. albicans beta- and beta'-subunits, respectively. The predicted beta- and beta'-proteins have calculated molecular masses of 34 kDa and 31 kDa and show all major features conserved in beta-subunits of other organisms, including the N-terminal autophosphorylation site, the internal acidic region and a potential metal-binding motif. The deduced amino acid sequence of C. albicans beta-subunit displays 48% identity with that of Saccharomyces cerevisiae and has an unusually long C-terminal acidic region containing a putative autophosphorylation site. C. albicans beta' shows 54% sequence identity with its S. cerevisiae homologue. Semi-quantitative RT-PCR analyses indicate that the mRNAs corresponding to both subunits are present in similar amounts in the yeast and hyphal forms of the fungus. To evaluate the biochemical properties of C. albicans beta- and beta'-subunits, both proteins were expressed in Escherichia coli and purified. Experiments performed in vitro indicate that both recombinant subunits reconstitute a fully functional holoenzyme when incubated with stoichiometric amounts of human recombinant alpha-subunit, as judged by their ability to abolish basal phosphorylation of calmodulin by human recombinant alpha-subunit and the reversion of the inhibitory effect by polylysine. In addition, both regulatory subunits can be phosphorylated by human recombinant alpha subunit. Phylogenetic analysis of beta- and beta'-proteins of C. albicans and other organisms shows that the CKB gene duplication occurred before the split of the ascomycete and basidiomycete lineages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».