Downregulation of GFAP, TSP‐1, and p53 in human glioblastoma cell line, U373MG, by IE1 protein from human cytomegalovirus
Notice bibliographique
Résumé
Human cytomegalovirus (HCMV) is a member of the beta-herpesvirus family, which has tropism for glial cells. It was recently reported that HCMV might play important roles in the pathogenesis of malignant glioma. In this study, we investigated the effects of the HCMV IE1 protein on the gene expression profile in the human glioblastoma cell line, U373MG by employing cDNA microarray technology. Using DNA chips containing approximately 1,000 human cDNAs, RNA samples from U373MG cells stably expressing IE1 were compared with those from the control cells lacking IE1 cDNA. Fluorescence intensities of 13 genes were significantly decreased in IE1-expressing cells, while one gene was found to be upregulated. Among these 14 genes, we chose to work further on glial fibrillary acidic protein (GFAP), thrombospondin-1 (TSP-1), and p53, because of their previously known involvement in tumorigenesis. The mRNA levels of all these genes were found to be decreased in IE1-expressing glioblastoma cells by real-time quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) as well as Northern blot analysis. The decreased expression of these genes was also observed at protein levels as measured by immunocytochemistry or fluorescence-activated cell sorting (FACS) analysis. Our data strongly suggested that HCMV IE1 could modulate the expression of cellular genes that might play important roles in the pathogenesis of glial tumors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».