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Enregistrement W2010594400 · doi:10.1016/s2095-3119(13)60600-0

A New Disease of Cherry Plum Tree with Yellow Leaf Symptoms Associated with a Novel Phytoplasma in the Aster Yellows Group

2014· article· en· W2010594400 sur OpenAlexaff
Zhengnan Li, Lei Zhang, Ye Tao, Ming Chi, Yu Xiang, Yunfeng Wu

Notice bibliographique

RevueJournal of Integrative Agriculture · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytoplasmas and Hemiptera pathogens
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesChinese Academy of Agricultural Sciences
Mots-clésPhytoplasmaBiologyAster yellowsRestriction fragment length polymorphism16S ribosomal RNAPhylogenetic treeBotanyRibosomal RNAHorticultureGenePolymerase chain reactionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A novel phytoplasma was detected in a cherry plum (Prunus cerasifera Ehrh) tree that mainly showed yellow leaf symptom. The tree was growing in an orchard located in Yangling District, Shaanxi Province, China. The leaves started as chlorotic and yellowing along leaf minor veins and leaf tips. Chlorosis rapidly developed to inter-veinal areas with the whole leaf becoming pale yellow in about 1-4 wk. Large numbers of phytoplasma-like bodies (PLBs) were seen under transmission electron microscopy. The majority of the PLBs was spherical or elliptical vesicles, with diameters in range of 0.1-0.6 µm, and distributed in the phloem cells of the infected tissues. A 1 246-bp 16S ribosomal RNA (rRNA) gene fragment was amplified from DNA samples extracted from the yellow leaf tissues using two phytoplasma universal primer pairs R16mF2/R16mR1 and R16F2n/R16R2. Phylogenetic analysis using the 16S rRNA gene sequence suggested that the phytoplasma associated with the yellow leaf symptoms belongs to a novel subclade in the aster yellows (AY) group (16SrI group). Virtual and actual restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the 16S rRNA gene fragment revealed that the phytoplasma was distinguishable from all existing 19 subgroups in the AY group (16SrI) by four restriction sites, Hinf I, Mse I, Sau3A I and Taq I. The similarity coefficients of comparing the RFLP pattern of the 16S rRNA gene fragment of this phytoplasma to each of the 19 reported subgroups ranged from 0.73 to 0.87, which indicates the phytoplasma associated with the cherry plum yellow leaf (CPYL) symptoms is probably a distinct and novel subgroup lineage in the AY group (16SrI). In addition, the novel phytoplasma was experimentally transmitted to periwinkle (Catharanthus roseus) plants from the tree with CPYL symptoms and then back to a healthy 1-yr-old cherry plum tree via dodder (Cuscuta odorata) connections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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