Analysis of single nucleotide polymorphisms in genes in the chromosome 12Q24.31 region points to P2RX7 as a susceptibility gene to bipolar affective disorder
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Previous results from our genetic analyses using pedigrees from a French Canadian population suggested that the interval delimited by markers on chromosome 12, D12S86 and D12S378, was the most probable genomic region to contain a susceptibility gene for affective disorders. Association studies with microsatellite markers using a case/control sample from the same population (n = 427) revealed significant allelic associations between the bipolar phenotype and marker NBG6. Since this marker is located in intron 9 of the P2RX7 gene, we analyzed the surrounding genomic region for the presence of polymorphisms in regulatory, coding and intron/exon junction sequences. Twenty four (24) SNPs were genotyped in a case/control sample and 12 SNPs in all pedigrees used for linkage analysis. Allelic, genotypic or family-based association studies suggest the presence of two susceptibility loci, the P2RX7 and CaMKK2 genes. The strongest association was observed in bipolar families at the non-synonymous SNP P2RX7-E13A (rs2230912, P-value = 0.000708), which results from an over-transmission of the mutant G-allele to affected offspring. This Gln460Arg polymorphism occurs at an amino acid that is conserved between humans and rodents and is located in the C-terminal domain of the P2X7 receptor, known to be essential for normal P2RX7 function.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle