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Enregistrement W2010667030 · doi:10.1139/g04-081

The genomic composition of Tricepiro, a synthetic forage crop

2005· article· en· W2010667030 sur OpenAlexvenueno aff
María Rosa Ferrari, Eduardo Greizerstein, Héctor Paccapelo, C. A. Naranjo, N. Jouve, Lidia Poggio

Notice bibliographique

RevueGenome · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Mots-clésTriticaleBiologyIntrogressionSecaleGenomeChromosomegenomic DNACropGermplasmGeneticsDNAAgronomyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chromosome in situ hybridization (FISH and GISH) is a powerful tool for determining the chromosomal location of specific sequences and for analysing genome organization and evolution. Tricepiro (2n = 6x = 42) is a synthetic cereal obtained by G. Covas in Argentina (1972), which crosses hexaploid triticale (2n = 6x = 42) and octoploid Trigopiro (2n = 8x = 56). Several years of breeding produced a forage crop with valuable characteristics from Secale, Triticum, and Thinopyrum. The aim of this work is to analyse the real genomic constitution of this important synthetic crop. In situ hybridization using total DNA of Secale, Triticum, and Thinopyrum as a probe (GISH) labelled with biotin and (or) digoxigenin showed that tricepiro is composed of 14 rye chromosomes and 28 wheat chromosomes. Small zones of introgression of Thinopyrum on wheat chromosomes were detected. The FISH using the rye repetitive DNA probe pSc 119.2 labelled with biotin let us characterize the seven pairs of rye chromosomes. Moreover, several wheat chromosomes belonging to A and B genomes were distinguished. Therefore, tricepiro is a synthetic hexaploid (2n = 6x = 42) being AABBRR in its genomic composition, with zones of introgression of Thinopyrum in the A genome of wheat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,967
Score d'incertitude au seuil0,336

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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