Cleavage of the Carboxyl Tail from the G3 Domain of Aggrecan but Not Versican and Identification of the Amino Acids Involved in the Degradation
Notice bibliographique
Résumé
Aggrecan, a major structural proteoglycan in cartilage, contains three globular domains, G1, G2, and G3, as well as sequences for glycosaminoglycan modification. A large number of proteases are implicated in aggrecan cleavage in normal metabolism, aging, and arthritis. These proteases are known to cleave at the IGD, KS, and CS domains. Here we report for the first time evidence of cleavage at a novel site, the carboxyl tail of aggrecan. Results from deletion mutants of the tail indicated that the likely cleavage sites were two consensus sequences, RRLXK and RSPR, present in the aggrecan analogs of many species. This was confirmed by site-directed mutagenesis. A construct containing two G3 domains (G3G3) was also found to cleave between the G3 duplicates. When G3 tail was linked to a glycosaminoglycan-modifying sequence, it was protected from cleavage. Furin inhibitor also reduced the levels of tail cleavage. The carboxyl tails of chicken and human versican were not cleaved, despite the presence of the consensus sequence. Our studies indicate that the basic amino acids present in the tail play an important role in cleavage, and this mechanism is specific to aggrecan.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».