Phenotyping stimulus evoked responses in larval zebrafish
Notice bibliographique
Résumé
The aim of the present study was to establish an effective method of analyzing individual variation in stimuli-evoked behavioural responses. The same genetic, environmental and experimental conditions were maintained throughout in order to limit variation. Naive larval zebrafish ages 5 and 7 days post fertilization were exposed to a water or chemical stimulus (adenosine) and observed for changes in bursting activity. Fish exposed to water demonstrated highly variable responses including increases, decreases and biphasic changes in bursting activity. Since the experimental settings were controlled, these differences between individuals may be related to fish personality. To interpret our data we applied a novel threshold based sorting protocol to each fish. Individuals were successfully grouped into 24 pre-defined behavioural response phenotypes. The phenotypes had distinct movement patterns and contained different proportions of fish. The same sorting method applied to adenosine exposed fish resulted in similar ratios of phenotypes. This suggests that solution addition as a stimulus evokes different yet replicable responses in a fish population. Comparisons within phenotypes and across treatments revealed subtle differences in activity between water and adenosine exposed fish. Adenosine treated fish had either increased or decreased bursting frequency depending on the response type. These results suggest that phenotypic separation prior to analysis enables observation of treatment differences that may have otherwise been missed. In summary, the present study demonstrates the practice of behavioural phenotyping as a successful method for analysis of individual variation in a population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».