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Enregistrement W2010781850 · doi:10.1158/1940-6207.capr-14-0057

Acyl-Coenzyme A–Binding Protein Regulates Beta-Oxidation Required for Growth and Survival of Non–Small Cell Lung Cancer

2014· article· en· W2010781850 sur OpenAlexaff
Fredrick T. Harris, S.M. Jamshedur Rahman, Mohamed Hassanein, Jun Qian, Megan D. Hoeksema, Heidi Chen, Rosana Eisenberg, Pierre Chaurand, Richard M. Caprioli, Masakazu Shiota, Pierre P. Massion

Notice bibliographique

RevueCancer Prevention Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésCell growthApoptosisCancer researchDownregulation and upregulationLung cancerImmunohistochemistryProgrammed cell deathCancerChemistryBiologyInternal medicineMedicineImmunologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We identified acyl-coenzyme A-binding protein (ACBP) as part of a proteomic signature predicting the risk of having lung cancer. Because ACBP is known to regulate β-oxidation, which in turn controls cellular proliferation, we hypothesized that ACBP contributes to regulation of cellular proliferation and survival of non-small cell lung cancer (NSCLC) by modulating β-oxidation. We used matrix-assisted laser desorption/ionization-imaging mass spectrometry (MALDI-IMS) and immunohistochemistry (IHC) to confirm the tissue localization of ABCP in pre-invasive and invasive NSCLCs. We correlated ACBP gene expression levels in NSCLCs with clinical outcomes. In loss-of-function studies, we tested the effect of the downregulation of ACBP on cellular proliferation and apoptosis in normal bronchial and NSCLC cell lines. Using tritiated-palmitate ((3)H-palmitate), we measured β-oxidation levels and tested the effect of etomoxir, a β-oxidation inhibitor, on proliferation and apoptosis. MALDI-IMS and IHC analysis confirmed that ACBP is overexpressed in pre-invasive and invasive lung cancers. High ACBP gene expression levels in NSCLCs correlated with worse survival (HR = 1.73). We observed a 40% decrease in β-oxidation and concordant decreases in proliferation and increases in apoptosis in ACBP-depleted NSCLC cells as compared with bronchial airway epithelial cells. Inhibition of β-oxidation by etomoxir in ACBP-overexpressing cells produced dose-dependent decrease in proliferation and increase in apoptosis (P = 0.01 and P < 0.001, respectively). These data suggest a role for ACBP in controlling lung cancer progression by regulating β-oxidation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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