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Enregistrement W2010803354 · doi:10.1093/jb/mvm054

Two Mutations Convert Mammalian Xanthine Oxidoreductase to Highly Superoxide-productive Xanthine Oxidase

2007· article· en· W2010803354 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Biochemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGout, Hyperuricemia, Uric Acid
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSuperoxideOxidoreductaseChemistryXanthine dehydrogenaseBiochemistryMutantHypoxanthineDithiothreitolCofactorXanthine oxidaseStereochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Reactive oxygen species are generated by various systems, including NADPH oxidases, xanthine oxidoreductase (XOR) and mitochondrial respiratory enzymes, and contribute to many physiological and pathological phenomena. Mammalian xanthine dehydrogenase (XDH) can be converted to xanthine oxidase (XO), which produces both superoxide anion and hydrogen peroxide in a molar ratio of about 1:3, depending upon the conditions. Here, we present a mutant of rat XOR that displays mainly XO activity with a superoxide:hydrogen peroxide production ratio of about 6:1. In the mutant, tryptophan 335, which is a component of the amino acid cluster crucial for switching from the XDH to the XO conformation, was replaced with alanine, and phenylalanine 336, which modulates FAD's redox potential through stacking interactions with the flavin cofactor, was changed to leucine. When the mutant was expressed in Sf9 cells, it was obtained in the XO form, and dithiothreitol treatment only partially restored the pyridine nucleotide-binding capacity. The crystal structure of the dithiothreitol-treated mutant at 2.3 Angstroms resolution showed the enzyme's two subunits to be quite similar, but not identical: the cluster involved in conformation-switching was completely disrupted in one subunit, but remained partly associated in the other one. The chain trace of the active site loop in this mutant is very similar to that of the bovine XO form. These results are consistent with the idea that the XDH and XO forms of the mutant are in an equilibrium that greatly favours the XO form, but the equilibrium is partly shifted towards the XDH form upon incubation with dithiothreitol.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,891

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle