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Enregistrement W2010815147 · doi:10.1152/ajprenal.00038.2012

Functional significance of conserved cysteines in the human organic cation transporter 2

2012· article· en· W2010815147 sur OpenAlexaff
Ryan M. Pelis, Yodying Dangprapai, Yaofeng Cheng, Xiaohong Zhang, Jennifer Terpstra, Stephen H. Wright

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Renal Physiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteFaculty of Medicine Siriraj Hospital, Mahidol UniversityNational Institutes of Health
Mots-clésChemistryCysteineTransmembrane domainBiochemistryMutantDithiothreitolSymporterTetraethylammoniumMutationTransporterStereochemistryBiophysicsMembraneEnzymeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The significance of conserved cysteines in the human organic cation transporter 2 (hOCT2), namely the six cysteines in the long extracellular loop (loop cysteines) and C474 in transmembrane helix 11, was examined. Uptake of tetraethylammonium (TEA) and 1-methyl-4-phenypyridinium (MPP) into Chinese hamster ovary cells was stimulated >20-fold by hOCT2 expression. Both cell surface expression and transport activity were reduced considerably following mutation of individual loop cysteines (C51, C63, C89, C103, and C143), and the C89 and C103 mutants had reduced Michaelis constants (K(t)) for MPP. The loop cysteines were refractory to interaction with thiol-reactive biotinylation reagents, except after pretreatment of intact cells with dithiothreitol or following cell membrane solubilization. Reduction of disulfide bridge(s) did not affect transport, but labeling the resulting free thiols with maleimide-PEO(2)-biotin did. Mutation of C474 to an alanine or phenylalanine did not affect the K(t) value for MPP. In contrast, the K(t) value associated with TEA transport was reduced sevenfold in the C474A mutant, and the C474F mutant failed to transport TEA. This study shows that some but not all of the six extracellular loop cysteines exist within disulfide bridge(s). Each loop cysteine is important for plasma membrane targeting, and their mutation can influence substrate binding. The effect of C474 mutation on TEA transport suggests that it contributes to a TEA binding surface. Given that TEA and MPP are competitive inhibitors, the differential effects of C474 modification on TEA and MPP binding suggest that the binding surfaces for each are distinct, but overlapping in area.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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