Structure, Dynamics, and Thermodynamics of the Structural Domain of Troponin C in Complex with the Regulatory Peptide 1−40 of Troponin I<sup>,</sup>
Notice bibliographique
Résumé
The structure of the calcium-saturated C-domain of skeletal troponin C (CTnC) in complex with a regulatory peptide comprising residues 1-40 (Rp40) of troponin I (TnI) was determined using nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. The solution structure determined by NMR is similar to the structure of the C-domain from intact TnC in complex with TnI(1)(-)(47) determined by X-ray crystallography [Vassylyev, D. G., Takeda, S., Wakatsuki, S., Maeda, K., and Maeda, Y. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95, 4847-4852]. Changes in the dynamic properties of CTnC.2Ca2+ induced by Rp40 binding were investigated using backbone amide (15)N NMR relaxation measurements. Analysis of NMR relaxation data allows for extraction of motional order parameters on a per residue basis, from which the contribution of changes in picosecond to nanosecond time scale motions to the conformational entropy associated with complex formation can be estimated. The results indicate that binding of Rp40 decreases backbone flexibility in CTnC, particularly at the end of the C-terminal helix. The backbone conformational entropy change (-TDeltaS) associated with binding of Rp40 to CTnC.2Ca2+ determined from (15)N relaxation data is 9.6 +/- 0.7 kcal mol(-1) at 30 degrees C. However, estimation of thermodynamic quantities using a structural approach [Lavigne, P., Bagu, J. R., Boyko, R., Willard, L., Holmes, C. F., and Sykes, B. D. (2000) Protein Sci. 9, 252-264] reveals that the change in solvation entropy upon complex formation is dominant and overcomes the thermodynamic "cost" associated with "stiffening" of the protein backbone upon Rp40 binding. Additionally, backbone amide (15)N relaxation data measured at different concentrations of CTnC.2Ca2+.Rp40 reveal that the complex dimerizes in solution. Fitting of the apparent global rotational correlation time as a function of concentration to a monomer-dimer equilibrium yields a dimerization constant of approximately 8.3 mM.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».