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Enregistrement W2011307240 · doi:10.3354/ame031203

Low fractions of active bacteria in natural aquatic communities?

2003· article· en· W2011307240 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueAquatic Microbial Ecology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacterioplanktonEcologyBiologyNatural (archaeology)NutrientPhytoplankton

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AME Aquatic Microbial Ecology Contact the journal Facebook Twitter RSS Mailing List Subscribe to our mailing list via Mailchimp HomeLatest VolumeAbout the JournalEditorsSpecials AME 31:203-208 (2003) - doi:10.3354/ame031203 Low fractions of active bacteria in natural aquatic communities? Erik M. Smith*, Paul A. del Giorgio Dépt des sciences biologiques, Université du Québec à Montréal, CP 8888, succursale Centre Ville, Montréal H3C 3P8, Canada *Email: smith.erik@uqam.ca ABSTRACT: The notion that a significant fraction of individual cells within natural bacterial assemblages is not actively engaged in cellular metabolism, although not a new idea, remains fairly contentious. Different approaches for probing the metabolic activity of individual cells often yield widely divergent estimates of the proportion of active cells, with some methods suggesting very low levels of individual cell activity. We comment on 2 aspects of the current discussions regarding cell-specific activity in natural bacterioplankton. First, the apparent perception that most aquatic bacteria must be active is not uniformly supported by the data. In a systematic survey of the microautoradiography literature, for example, only 4 out of 23 studies reported a mean proportion of active cells in natural communities that was greater than 50%, and the mean across all such studies was 30%. Second, we propose that the problem of describing bacterioplankton single-cell activity is best approached from the viewpoint that there is a nested hierarchy of physiological states within bacterial communities. The lack of agreement among various methods points to the large range of criteria possible for describing metabolic activity in bacteria. In this regard, the discrete, and over-simplistic, notion of 'active' versus 'inactive' is not particularly useful and should be replaced by a conceptual model in which there exists a continuum of possible single-cell activities. KEY WORDS: Bacteria · Cell-specific activity · Physiological diversity · Methodological approaches Full text in pdf format PreviousExport citation RSS - Facebook - Tweet - linkedIn Cited by Published in AME Vol. 31, No. 2. Online publication date: March 13, 2003 Print ISSN: 0948-3055; Online ISSN: 1616-1564 Copyright © 2003 Inter-Research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,764
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0200,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle