Evolution in Reverse Gear: The Molecular Basis of Loss and Reversal
Notice bibliographique
Résumé
Three types of regressive evolution are reviewed: loss, reversal, and regain after loss. Loss refers to the loss of a physical entity, either a structure or an organ, whereas reversals apply to character states returning to plesiomorphic from apomorphic conditions. The regain of characters after their loss represents a third type of evolutionary character change. The reconstruction of multiple losses and gains of characters by mapping on phylogenies is often problematic because of a lack of information about the relative likelihood of losses and gains. A developmental genetic approach using morphological, developmental, and molecular analysis is therefore an extremely important adjunct to phylogenetic approaches in interpreting losses, reversals, and regains. The molecular developmental basis of character loss and reversal is gradually becoming better understood. Loss of organs can occur by gain-of-function mutations (suppression) and loss-of-function mutations (that often leave a vestigial structure). The regain of characters after loss may occur by regulatory capture (a gain-of-function mutation) or by loss of function in suppressor genes. Reversals may occur by cryptic innovation (the formation of a new structure that mimics the old structure by gain-of-function mutations) or by loss of gene function associated with the apomorphic state (although this may have pleitropic or neomorphic effects). The genetic landscape of reversal is illustrated by the reversal to polysymmetry from monosymmetry in flowers. The range of observed phenotypes, loss with vestige, cryptic innovation, and loss with neomorphism matches the range of changes predicted."In plants with separated sexes, the male flowers often have a rudiment of a pistil; and Kolreuter found that by crossing such male plants with an hermaphrodite species, the rudiment of the pistil in the hybrid offspring was much increased in size; and this shows that the rudiment and the perfect pistil are essentially alike in nature" (Darwin 1859).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».