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Enregistrement W2011352938 · doi:10.1101/sqb.2009.74.034

Evolution in Reverse Gear: The Molecular Basis of Loss and Reversal

2009· review· en· W2011352938 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology · 2009
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNorth Carolina State UniversityNational Evolutionary Synthesis Center
Mots-clésLoss functionBiologyPhenotypeFunction (biology)Evolutionary biologyMutationGeneticsMorphology (biology)PhylogeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Three types of regressive evolution are reviewed: loss, reversal, and regain after loss. Loss refers to the loss of a physical entity, either a structure or an organ, whereas reversals apply to character states returning to plesiomorphic from apomorphic conditions. The regain of characters after their loss represents a third type of evolutionary character change. The reconstruction of multiple losses and gains of characters by mapping on phylogenies is often problematic because of a lack of information about the relative likelihood of losses and gains. A developmental genetic approach using morphological, developmental, and molecular analysis is therefore an extremely important adjunct to phylogenetic approaches in interpreting losses, reversals, and regains. The molecular developmental basis of character loss and reversal is gradually becoming better understood. Loss of organs can occur by gain-of-function mutations (suppression) and loss-of-function mutations (that often leave a vestigial structure). The regain of characters after loss may occur by regulatory capture (a gain-of-function mutation) or by loss of function in suppressor genes. Reversals may occur by cryptic innovation (the formation of a new structure that mimics the old structure by gain-of-function mutations) or by loss of gene function associated with the apomorphic state (although this may have pleitropic or neomorphic effects). The genetic landscape of reversal is illustrated by the reversal to polysymmetry from monosymmetry in flowers. The range of observed phenotypes, loss with vestige, cryptic innovation, and loss with neomorphism matches the range of changes predicted."In plants with separated sexes, the male flowers often have a rudiment of a pistil; and Kolreuter found that by crossing such male plants with an hermaphrodite species, the rudiment of the pistil in the hybrid offspring was much increased in size; and this shows that the rudiment and the perfect pistil are essentially alike in nature" (Darwin 1859).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle