Characterization of antimicrobial resistance, molecular and phage types of<i>Salmonella enterica</i>serovar Typhi isolations
Notice bibliographique
Résumé
Isolation rates in Canada of Salmonella enterica serovar Typhi increased from 0.29 to 0.55 isolations/100,000 population during 2000-2006. Although no ciprofloxacin resistance was detected, nalidixic acid resistance increased from 41% to 80%. Multidrug-resistant S. Typhi represented 18% of the strains tested. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) analysis of 222 isolates resulted in 91 distinct patterns clustering into four major genetic similarity groups. The five most frequently occurring PFGE patterns accounted for 46% of the isolates. Drug-resistant isolates predominantly occurred in one PFGE similarity group. There were 39 phage types identified in 826 isolates analysed with 60% described by five phage types; 134 were untypable. The phage types associated with multidrug resistance were phage types 53, B1, D1, E1, E9, G3 and M1. Improved integration of epidemiological and laboratory case data will facilitate the protection of public health in Canada during an era of increasing travel and globalization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».