MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2011356183 · doi:10.1111/j.1462-5822.2008.01268.x

Regulation of<i>Salmonella</i>-induced membrane ruffling by SipA differs in strains lacking other effectors

2008· article· en· W2011356183 sur OpenAlexaff
Charlotte A. Perrett, Mark A. Jepson

Notice bibliographique

RevueCellular Microbiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMembrane rufflingSalmonella entericaBiologyEffectorSalmonellaMicrobiologyType three secretion systemCell biologyMutantCellBacteriaGeneticsCytoskeletonGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Salmonella pathogenicity island 1 (SPI-1) type three secretion system (TTSS) is essential for Salmonella invasion of host cells through its triggering of actin-dependent membrane ruffles. The SPI-1 effectors SipA, SopE, SopE2 and SopB all have actin regulating activities and contribute to invasion. The precise role of actin regulation by SipA in Salmonella invasion remains controversial since divergent data have been presented regarding the relationship between SipA and membrane ruffling. We hypothesized that the contribution of SipA to membrane ruffling and invasion might vary between Salmonella strains. We compared the effects of SipA deletion on Salmonella enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) strains that possess or lack SopE. Loss of SipA reduced invasion in the early stages of infection by SopE(+) and SopE(-) strains but the number of membrane ruffles elicited was unaffected. Salmonella strains lacking both SipA and SopE induced ruffles with very different morphology from those induced by wild-type strains or ones lacking single effectors, including the presence of highly dynamic finger-like protrusions and numerous filopodia. A similar phenotype was found for sipA(-)sopE(-), sipA(-)sopE2(-) and sipA(-)sopB(-) mutants. Thus, SipA plays a more prominent role in induction of invasion-competent membrane ruffles by Salmonella lacking a full complement of SPI-1 effectors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCellular MicrobiologyMême sujetSalmonella and Campylobacter epidemiologyTravaux en français237 207