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Enregistrement W2011418661 · doi:10.1165/rcmb.2009-0231oc

Functions of Membrane Binding Domain of CTP:Phosphocholine Cytidylyltransferase in Alveolar Type II Cells

2009· article· en· W2011418661 sur OpenAlexafffund
Ross Ridsdale, Irene Tseu, Jinxia Wang, Martin Post

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueATP Synthase and ATPases Research
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPhosphocholineChemistryMembraneDomain (mathematical analysis)Cell biologyBiochemistryBiophysicsBiologyPhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CTP:phosphocholine cytidylyltransferase (CCTalpha) plays a key role in the biosynthesis of surfactant phosphatidylcholine. In this study, we investigated the role of its membrane-binding (M) domain in modulating its structure, function, and cellular distribution. Multiple enhanced green fluorescent protein-CCTalpha constructs were generated to evaluate the subcellular distribution in A549 cells. The M domain targeted CCTalpha to the perinuclear (membrane-rich) region. Microinjections with glutathione-S-transferase fusion protein containing the M domain corroborated the perinuclear targeting. Deletion of the M domain or substitutions of the hydrophobic residues with arginine/serine in the VEEKS(267-277) motif of the M domain resulted in a nuclear appearance and indented nuclei. Membrane binding of CCTalpha decreased gradually as the number of positively charged arginine residues increased in the VEEKS motif. To identify whether membrane-protein interactions cause structural alterations in CCTalpha, we visualized the protein in the absence and presence of lipids by transmission electron microscopy. These studies revealed that CCTalpha forms a dimer-like complex that condenses upon binding to lipid vesicles, but not lipid monolayers. The influence of the M domain on CCTalpha activity was assessed in transgenic mice overexpressing the N-terminal catalytic domain (CCTalpha(1-239)), N-terminal catalytic plus M domain (CCTalpha(1-290)), or full-length CCTalpha(1-367) in fetal type II cells by using the surfactant protein C promoter. Only overexpression of CCTalpha(1-367) increased surfactant phosphatidylcholine synthesis. Thus, the M domain influences membrane binding, cellular distribution, and topology of CCTalpha, but the domain alone is not sufficient to confer CCT activity in alveolar type II cells in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,537

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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