Entrapment of Living Bacterial Cells in Low-Concentration Silica Materials Preserves Cell Division and Promoter Regulation
Notice bibliographique
Résumé
The entrapment of bacterial cells within inorganic silica materials was reported almost 20 years ago. However, almost all studies to date have shown that these entrapped cells are unable to divide and thus should be expected to have reduced promoter activity. In view of the importance of bacteria as model systems for both fundamental and applied biological studies, it is crucial that immobilized cells retain solutionlike properties, including the ability to divide and display normal promoter activity. Herein we report on a method to immobilize bacterial cells within low-density inorganic silica-based materials, where the cells retain both cell division and promoter activity. Sol–gel processing was used to entrap Escherichia coli cells carrying a variety of green fluorescent protein-linked promoters into sodium silicate-derived materials that were formed in microwell plates. Using a series of assays, we were able to demonstrate that (1) the entrapped cells can divide within the pores of the silica matrix, (2) cellular pathways are regulated in a similar manner in both solution and the sol–gel-derived materials, and (3) promoters in entrapped cells can be specifically induced with small molecules (e.g., antimicrobial compounds) in a concentration-dependent manner to allow assessment of both potency and mode of action. This solid-phase assay system was tested using multiple antimicrobial pathways and should enable the development of solid-phase assays for the discovery of new small molecules that are active against bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».