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Enregistrement W2011515721 · doi:10.1021/cm403198z

Entrapment of Living Bacterial Cells in Low-Concentration Silica Materials Preserves Cell Division and Promoter Regulation

2013· article· en· W2011515721 sur OpenAlexaff
Nikolas Eleftheriou, Xin Ge, Julia Kolesnik, Shannon B. Falconer, R. J. C. Harris, Cezar M. Khursigara, Eric D. Brown, John D. Brennan

Notice bibliographique

RevueChemistry of Materials · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of GuelphMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell divisionPromoterEscherichia coliBacteriaChemistryBiophysicsAntimicrobialSodium silicatePromoter activityCellNanotechnologyBiochemistryBiologyMaterials scienceGene expressionGeneGeneticsOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The entrapment of bacterial cells within inorganic silica materials was reported almost 20 years ago. However, almost all studies to date have shown that these entrapped cells are unable to divide and thus should be expected to have reduced promoter activity. In view of the importance of bacteria as model systems for both fundamental and applied biological studies, it is crucial that immobilized cells retain solutionlike properties, including the ability to divide and display normal promoter activity. Herein we report on a method to immobilize bacterial cells within low-density inorganic silica-based materials, where the cells retain both cell division and promoter activity. Sol–gel processing was used to entrap Escherichia coli cells carrying a variety of green fluorescent protein-linked promoters into sodium silicate-derived materials that were formed in microwell plates. Using a series of assays, we were able to demonstrate that (1) the entrapped cells can divide within the pores of the silica matrix, (2) cellular pathways are regulated in a similar manner in both solution and the sol–gel-derived materials, and (3) promoters in entrapped cells can be specifically induced with small molecules (e.g., antimicrobial compounds) in a concentration-dependent manner to allow assessment of both potency and mode of action. This solid-phase assay system was tested using multiple antimicrobial pathways and should enable the development of solid-phase assays for the discovery of new small molecules that are active against bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,100
Score d'incertitude au seuil0,980

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0210,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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