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Enregistrement W2011521085 · doi:10.1016/j.eururo.2014.01.007

Systematic Review and Meta-analysis of Candidate Gene Association Studies of Lower Urinary Tract Symptoms in Men

2014· review· en· W2011521085 sur OpenAlexaff
Rufus Cartwright, Altaf Mangera, Kari A.O. Tikkinen, Prabhakar Rajan, Jori S. Pesonen, Anna C. Kirby, Ganesh Thiagamoorthy, Chris Ambrose, Juan Gonzalez‐Maffe, Phillip R. Bennett, Tom Palmer, Andrew J. Walley, Marjo‐Riitta Järvelin, Vik Khullar, Christopher R. Chapple

Notice bibliographique

RevueEuropean Urology · 2014
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUrinary Bladder and Prostate Research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésMedicineMeta-analysisOdds ratioConfidence intervalLower urinary tract symptomsPublication biasCandidate geneSystematic reviewInternal medicineMEDLINEBioinformaticsGeneticsGeneBiologyProstate

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CONTEXT: Although family studies have shown that male lower urinary tract symptoms (LUTS) are highly heritable, no systematic review exists of genetic polymorphisms tested for association with LUTS. OBJECTIVE: To systematically review and meta-analyze studies assessing candidate polymorphisms/genes tested for an association with LUTS, and to assess the strength, consistency, and potential for bias among pooled associations. EVIDENCE ACQUISITION: A systematic search of the PubMed and HuGE databases as well as abstracts of major urologic meetings was performed through to January 2013. Case-control studies reporting genetic associations in men with LUTS were included. Reviewers independently and in duplicate screened titles, abstracts, and full texts to determine eligibility, abstracted data, and assessed the credibility of pooled associations according to the interim Venice criteria. Authors were contacted for clarifications if needed. Meta-analyses were performed for variants assessed in more than two studies. EVIDENCE SYNTHESIS: We identified 74 eligible studies containing data on 70 different genes. A total of 35 meta-analyses were performed with statistical significance in five (ACE, ELAC2, GSTM1, TERT, and VDR). The heterogeneity was high in three of these meta-analyses. The rs731236 variant of the vitamin D receptor had a protective effect for LUTS (odds ratio: 0.64; 95% confidence interval, 0.49-0.83) with moderate heterogeneity (I(2)=27.2%). No evidence for publication bias was identified. Limitations include wide-ranging phenotype definitions for LUTS and limited power in most meta-analyses to detect smaller effect sizes. CONCLUSIONS: Few putative genetic risk variants have been reliably replicated across populations. We found consistent evidence of a reduced risk of LUTS associated with the common rs731236 variant of the vitamin D receptor gene in our meta-analyses. PATIENT SUMMARY: Combining the results from all previous studies of genetic variants that may cause urinary symptoms in men, we found significant variants in five genes. Only one, a variant of the vitamin D receptor, was consistently protective across different populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,753
Score d'incertitude au seuil0,830

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0110,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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