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Enregistrement W2011636377 · doi:10.1080/07060661.2015.1039062

Mechanism of antagonism by <i>Streptomyces griseocarneus</i> (strain Di944) against fungal pathogens of greenhouse-grown tomato transplants

2015· article· en· W2011636377 sur OpenAlexaffvenue
Siva Sabaratnam, J. A. Traquair

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRhizoctonia solaniBotrytis cinereaPythium ultimumFusarium oxysporumMicrobiologyAlternaria alternataVerticillium dahliaeAntagonismOomyceteRhizosphereMyceliumBotanyAlternaria solaniPhytophthora capsiciDamping offFusarium solaniStreptomycesBacteriaPhytophthoraFungicidePathogenBiological pest control

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antagonism by Streptomyces griseocarneus Benedict (strain Di944), a filamentous bacterium isolated from the rhizosphere of a field tomato plant, was investigated in culture and in the rhizospheres of tomato to understand the mechanisms of suppression of damping-off and root rot of tomato plug transplants. The bacterium inhibited Rhizoctonia solani Kühn, the oomycete pathogens Pythium and Phytophthora spp., and fungal pathogens including Alternaria alternata, Botrytis cinerea, Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, F. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici, F. solani, Thielaviopsis basicola and Verticillium dahlia, but not bacterial pathogens of tomato as determined by agar diffusion bioassay. Standard physicochemical analyses of the metabolites extracted from cell-free culture filtrates of S. griseocarneus Di944 identified the presence of an antifungal compound, a pentaene macrolide complex, designated as rhizostreptin. This antifungal compound was also detected by ultra-violet spectrophotometry and high performance liquid chromatography in the extract from the rhizospheres of tomato transplants grown from seeds treated with S. griseocarneus Di944 and, thus, found to be suppressive to damping-off caused by R. solani. Germination of spores and growth of mycelia of pathogenic fungi of tomato were inhibited by rhizostreptin at concentrations between 0.5 and 2 µg mL−1. Rhizostreptin was found to be more fungitoxic than other known polyene macrolides, amphotericin-B, nystatin, filipin and candicidin-type heptaene, as determined by agar diffusion bioassay. A substantial growth of S. griseocarneus Di944 in mineral medium supplemented with cell-wall components of R. solani indicated the ability of the bacterium to utilize fungal cell-wall components as carbon and nitrogen sources. This was further confirmed by the production of hydrolytic enzymes chitinase, glucanase, phospholipase and proteinase, by S. griseocarneus Di944 grown in mineral medium supplemented with glucose and (NH4)2SO4 or cell-wall components of R. solani as carbon and nitrogen sources. Secretion of extracellular antifungal pentaene macrolide and fungal cell-wall degrading enzymes is believed to be the major mechanism by which the necrotrophic mycoparasite S. griseocarneus Di944 inhibits fungi and oomycetes responsible for damping-off and root rot of tomato transplants. However, studies involving mutant strains of S. griseocarneus Di944 that are incapable of producing antifungal pentaene and fungal cell-wall degrading enzymes are needed to further confirm the mechanisms of antagonism by S. griseocarneus Di944.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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