Biochemical analysis of a Ca<sup>2+</sup>‐dependent membrane–membrane interaction mediated by the sea urchin yolk granule protein, toposome
Notice bibliographique
Résumé
Toposome, a high molecular mass protein, is an abundant component of the yolk granule in the sea urchin egg and embryo. Toposome is composed of a 160 kDa polypeptide that is proteolytically processed into smaller species of 120 and 90 kDa during embryonic development. The exact biological function of toposome during early development is unknown. In this study we have examined calcium binding to toposome and the effect of this binding on the secondary and tertiary structural characteristics of the purified protein. Initially, we used equilibrium dialysis to quantify calcium binding to toposome. Monophasic binding of up to 600 M of calcium per mole of protein was detected with an intrinsic dissociation constant (calcium) of 240 microm. Increasing concentrations of calcium resulted in an increase in alpha helical content from 3.0 to 22.0%, which occurred with an apparent dissociation constant (calcium) of 25 microm. In parallel experiments, toposome binding to liposomes required similar concentrations of calcium; an apparent dissociation constant (calcium) of 25 microm was recorded. Endogenous tryptophan fluorescence measurements, both in the presence and absence of liposomes, demonstrated that the tertiary structure is sensitive to increasing concentrations of calcium with an apparent dissociation constant (calcium) of 240 microm. Toposome-driven, liposome aggregation assays revealed a similar calcium requirement. Collectively, these results define a two-step model for calcium modulation of toposome structure and function.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».