Recovery and Quantification of <i>Mycobacterium Immunogenum</i> DNA from Metalworking Fluids Using Dual-Labeled Probes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Mycobacteria in metalworking fluids (MWF) are associated with hypersensitivity pneumonitis but are difficult to recover using culture. Quantitative PCR is a promising approach to quantify mycobacteria, but three challenges exist: mycobacterial cell lysis, high-yield DNA extraction, and removal of PCR inhibitors. We used Mycobacterium spp. primers to amplify polymorphic regions of 16S-rDNA flanked with highly conserved regions. A standard curve was constructed by cloning M. immunogenum amplification product. We developed single tube DNA extraction employing mixer mill cell disruption, enzymatic digestions (lysozyme, proteinase K) followed by a mechanical disruption, and column purification. MWF was spiked with M. immunogenum, and DNA was successfully extracted. Mycobacterial 16S-RNA genes were quantified by comparing PCR amplification detection (Cycle Threshold) from our samples with that obtained from the standard curve. Recovery and quantification of mycobacterial DNA from spiked samples approached 100 %. A rapid method for quantification of mycobacteria in MWF was demonstrated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».